《河海大學學報（自然科學版）》創辦于1957年，雙月刊，每逢單月25日出版，是以水資源開發、利用與保護為重點的綜合性學術期刊。近年來已多次榮獲“中國期刊方陣‘雙效期刊’”、“中國高校精品科技期刊”、“全國水利系統優秀期刊”和“江蘇省優秀期刊”等諸多獎項。
《河海大學學報（自然科學版）》主要刊登河海大學在水資源、水文、水利水電工程、水運工程、海洋及海岸工程、環境科學工程、水力學及河流動力學、水工結構、巖土工程、工程力學等學科的最新科研成果與學術論文，也刊登國內其他高校及研究機構相關學科具有較高學術水平的優秀論文。主要欄目有水文水資源與環境、土木工程、水利水電工程、港口航道與海洋工程、機電與信息工程等。本刊的主要讀者對象為與上述學科有關的科研人員、教學人員、工程技術人員以及相關專業研究生。
《河海大學學報（自然科學版）》聘請了海內外水科學與水技術領域的著名專家、中國工程院院士、中國科學院的院士擔任本刊顧問或編委。本刊入編的數據庫和文摘有：荷蘭Scopus數據庫、美國《劍橋科學文摘》（CSA）、美國《化學文摘》（CA）、俄羅斯《文摘雜志》（AJ）、波蘭《哥白尼索引》(IC)、中國科學引文數據庫(核心庫)（CSCD）、中國學術期刊綜合評價數據庫（CAJCED）、中國科技論文統計與分析數據庫、中國學術期刊文摘、中國力學文摘、中國物理文摘、中國數學文摘、中國地理科學文摘、水路運輸文摘等。獲獎情況：全國優秀高校自然科學學報二等獎；全國水利系統優秀期刊；江蘇省優秀期刊；中國期刊方陣“雙效期刊”；中國高校精品科技期刊；2012年第四屆中國高校優秀科技期刊獎；2013年首屆江蘇省新聞出版政府獎提名獎。
CA 化學文摘(美)，CSCD 中國科學引文數據庫來源期刊(含擴展版)，JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)，Pж(AJ) 文摘雜志(俄)，萬方收錄(中)，上海圖書館館藏，劍橋科學文摘，北大核心期刊(中國人文社會科學核心期刊)，哥白尼索引(波蘭)，國家圖書館館藏，文摘與引文數據庫，文摘雜志，知網收錄(中)，統計源核心期刊(中國科技論文核心期刊)，維普收錄(中)，
水文水資源與環境、土木工程、水利水電工程、港口航道與海洋工程、機電與信息工程
1、《河海大學學報（自然科學版）》文章要有所創新，論點明確，論據充分，數據可靠，論證嚴格，邏輯性強；條理清楚，文字精煉。
2、《河海大學學報（自然科學版）》文章一般應包括：標題、作者姓名和工作單位(院、系、所)、摘要、關鍵詞(3～8個)、引言、正文(包括論證、結論和建議)、參考文獻、英文摘要等項。
3、《河海大學學報（自然科學版）》每篇篇幅一般不超過5000字，短文一般不超過2500字(包括圖表)。標題一般不超過20字，中文摘要篇幅以250字左右為宜，英文摘要應與之相對應。提供的稿件應為打印稿，做到表格設計合理，圖和照片清晰。
4、內容符合“保密法”規定，在政治和涉外問題上，應符合國家有關政策。
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