《棉花學報》由中國農學會主辦，著重報道有關棉花等經濟作物的研究報告、試驗簡報、綜合評述、經驗交流、應用技術、科技簡訊、信息研究及有關其他生物、綠色食品和環境保護等科技文章。以圍繞棉花管理、經營、使用提供信息、傳授技術、交流經驗、普及知識為主要內容。
CSCD 中國科學引文數據庫來源期刊(含擴展版)，JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)，萬方收錄(中)，上海圖書館館藏，農業與生物科學研究中心文摘，北大核心期刊(中國人文社會科學核心期刊)，國家圖書館館藏，知網收錄(中)，統計源核心期刊(中國科技論文核心期刊)，維普收錄(中)，
研究與進展、研究簡報、專題與述評
1棉花學報專題評述能夠反映某個學科或研究領域的最新成果的研究進展、存在的問題以及今后的方向，論文篇幅不限。作者本人或所在室驗室在本領域有相當的研究經歷和科研成果。
2棉花學報研究論文反映我國植物分子生物學和分子育種領域在基礎理論、應用研究和高新技術開發方面的、在國內外公開出版的刊物上尚未發表過的原始研究工作報告。
3棉花學報研究報告為爭取時間以簡要的形式發表的原始研究工作報告。論文篇幅要求在5-8個印刷頁面左右。
4棉花學報專題介紹主要介紹植物分子生物學與分子育種領域的文獻綜述性論文。論文篇幅要求在6個印刷頁面以上。
5學位論文簡報主要刊登博士學位論文及優秀碩士論文之大摘要。篇幅要求在2個印刷頁面。中英文同時刊登。
6新基因、新種質、新品種主要刊登具有自主知識產權的新基因，經過鑒定或品種審定的新材料及品種。篇幅要求在6個印刷頁面左右。
7新思路、新技術、新方法主要刊登我國學者自主發明的新思路、新技術和新方法。篇幅要求在6個印刷頁面左右。
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