《菌物學報》（雙月刊）（英文刊名Mycosystema）的前身為《真菌學報》，創刊于1982年，是由中國科學院主管、中國菌物學會主辦的我國菌物學（真菌、粘菌、卵菌）領域的專門學術期刊。
《菌物學報》報道該領域的最新研究進展和具創造性或較高學術水平的論文和簡報。已在國內外學術界享有較高的聲譽，對繁榮和發展我國真菌科學并與國際接軌作出了積極貢獻。
CA 化學文摘(美)，CSCD 中國科學引文數據庫來源期刊(含擴展版)，萬方收錄(中)，上海圖書館館藏，農業與生物科學研究中心文摘，劍橋科學文摘，北大核心期刊(中國人文社會科學核心期刊)，哥白尼索引(波蘭)，國家圖書館館藏，知網收錄(中)，統計源核心期刊(中國科技論文核心期刊)，維普收錄(中)，
菌物系統分類學及菌物多樣性、菌物資源開發利用、真菌生態及生物防治、菌物共生作用、真菌毒素、致病真菌、菌物學研究的新方法、新技術
要求文章論點明確，數據可靠，層次清晰，文字精練，論文前附中英文摘要及關鍵詞（關鍵詞3-7個，且不得與題目重復），中間用逗號分開。
1圖表要求
照片要清晰，線圖要精繪（要有比例尺），避免圖、表、文內容重復。圖片需標明圖題、圖注，并采用中英文雙語表示。表格為標準三線表格，采用“插入表格”方式制作，表格全部內容需以中英文雙語表示。
2遵守命名法規
發表新分類單位要符合《國際植物命名法規》的各項規定，標本引證應寫寄主或基物、省名、縣（山）名、采集人、采集號或標本號（模式標本可加采集或分離時間、生境）。模式標本或培養物應注明存放地點。學名定名人縮寫應符合國際標準，例趙繼鼎應寫J.D.Zhao而不是J.Zhao。文章署名應為ZHAOJi-Ding。學名一律使用斜體，每個學名在正文中第一次出現時須有定名人，拉丁學名與中文學名并列不加括號。
3參考文獻
文中參考文獻采用“著者-出版年”制。在論文中標注的格式：例戴芳瀾（1979）或（戴芳瀾1979），（Arthur&Cummins1936），（莊劍云和魏淑霞1994）或（Smithetal.1981）。
文末參考文獻中文按照漢語拼音字母順序排列，西文按姓氏字母順序排列，作者必須全部列出。
4關于測序類文章
凡涉及DNA、RNA或蛋白質序列測定的論文，請先通過計算機網絡進入國際基因庫EMBL（歐洲）或GenBank（美國）或DDBJ（日本），申請得到國際基因庫接受號（AccessionNo.）后再進行投稿。
5注意英文寫作
在國外，本刊也有一批讀者。要求來稿英文題目準確無錯，英文摘要和英文圖注和表注盡量詳細，盡量做到國外同行在看不懂中文內容的情況下，可以從英文摘要和圖注、表注中獲得必要的信息。對中英文寫作距發表水平較遠的稿件，編輯部將直接退稿。
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